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bergey細菌鑒定手冊

今天小編就為大家分享一篇bergey細菌鑒定手冊,具有很好的參考價值,希望對大家有所幫助。
《伯杰氏系統(tǒng)細菌學手冊》(Bergey’s manual of systematic bacteriology(second edition,20xx年第1版,后于1925、1930、1934、1939、1948、1957、1974年相繼出版了第2至第8版,每個版本都反映了當時細菌學發(fā)展的新成就。其中第8版有美、英、德、法等14個國家的細菌學家參加了編寫工作,對系統(tǒng)內的每一屬和種都做了較詳細的屬性描述

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。近年來,由于細胞學、遺傳學和分子生物學的滲透,大大促進了細菌分類學的發(fā)展,使分類系統(tǒng)與真正反映親緣關系的自然體系日趨接近。第9版(1984,1986)中實質性的變化,象征著細菌分類學的發(fā)展進入新的階段

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。第一,手冊更名,原書名為《伯杰氏鑒定細菌學手冊》(Bergey's Manual of Determinative Bacteriology),第9版由于內容增加,范圍擴大,提高了手冊的實用性,同時指出各類細菌間的關系,所以改名為《伯杰氏系統(tǒng)細菌學手冊》;第二,由1卷分成4卷,這是考慮到能及時反映新進展和使用者的方便;第三,細菌在生物界的地位,8、9版間無變動,但它們的高級分類單位有很大變化(見下表),尤其嗜鹽細菌和產甲烷細菌,根據胞壁分析和DNA序列分折,另列疵壁菌門,古細菌綱;第四,趨近自然體系,在各級分類單位中全面應用核酸研究;在表型特征的基礎上,以DNA資料給予決定性的判斷。使人為的分類體系過渡到自然體系的理想進一步付諸實現(xiàn)

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。
細菌高級分類單位
原核生物界(Procaryotae)
薄壁菌門(Gracilicutes)
暗細菌綱(Scotobacteria)
無氧光細菌綱(Anoxyphotobacteria)
產氧光細菌綱(Oxyphotobacteria)
厚壁菌門(Firmicutes)
厚壁菌綱(Firmicuteria)
放線菌綱(Thallobacteria)
軟壁菌門(Tendericutes)
柔膜菌綱(Mollicuteria)
疵壁菌門(Mendosicutes)
古細菌綱(Archacobacter
伯杰氏系統(tǒng)細菌學手冊(20xx年第一版開始發(fā)行以來,細菌分類已取得了巨大進展,新命名的種成倍增加、新描述的屬也在170個以上,尤其是80年代末以來,rRNA、DNA、蛋白質序列分析方法日趨實用,因而為細菌的系統(tǒng)發(fā)育積累了不少新的資料。因此已經有可能對其第一版進行新的修訂

一直以來有句話想對你說,但苦于沒有機會,今天我終于鼓起勇氣……生日快樂!

。第二版預計分5卷出版,從已報導的資料看,它更多地依靠系統(tǒng)發(fā)育資料對細菌分類群的總體安排進行了較大的調整。第二版將原核生物分為30組,5卷大致的內容安排如下:?
第一卷:1~14組。包括古生菌、藍細菌、光合細菌和最早分支的屬?
第二卷:15~19組。包括變形桿菌(屬革蘭氏陰性真細菌類)?
第三卷:20~22組。包括低G+C含量的革蘭氏陽性細菌?
第四卷:23組。包括高G+C含量的革蘭氏陽性細菌(放線菌類)?
第五卷:24~30組。包括浮霉狀菌、螺旋體、絲桿菌、擬桿菌和梭桿菌(屬革蘭氏陰性細菌類)?
有關系統(tǒng)手冊第二版的分類大綱見下表?
表 伯杰氏系統(tǒng)細菌學手冊第二版分類綱要
分類群 代表屬
一、古生菌、藍細菌、光合細菌和最早分支的屬古生菌
嗜泉古生菌界(Crenarchaeota)
1 組 熱變形菌、硫化葉菌和嗜壓菌 熱變形菌屬(Thermoproteus)、硫化葉菌 屬(Sulfolobus)
廣古生菌界 (Euryarchaeota)
2 組 產甲烷菌 甲烷桿菌屬(Methanobacterium)
3 組 鹽桿菌 鹽桿菌屬(Halobacterium)、鹽球菌屬(Halococcus)
4 組 熱原體 熱原體屬(Thermoplasma)等
5 組 熱球菌 古生球菌屬(Archaeoglobus)、熱球菌屬(Thermococcus)
最早分支的屬
細菌(真細菌)
6 組 產液菌和有關的細菌 產液菌屬(Aquifex)、氫桿菌屬(Hydrogenobacter)
7 組 熱袍菌和地袍菌 熱袍菌屬(Thermotoga)、地袍菌 屬(Geotoga)、熱脫硫桿菌屬(Thermodesulfobacterium)
8 組 異常球菌 異常球菌屬(Deinococcus)
9 組 棲熱菌 棲熱菌屬(Thermus)、磁桿菌屬(Magnetobacterium)
10組 產金色菌 產金色菌屬(Chrisiogenes)
11組 綠屈撓菌和滑柱菌 綠屈撓菌屬(Chloroflexus)、滑柱菌屬(Herpetosiphon)
12組 熱微菌 熱微菌屬(Thermomicrobium)
13組 原綠藍細菌和藍細菌 原綠藍細菌屬(Prochloron) 、聚球藍細菌屬(Synechococcus)、顫藍細菌屬(Oscillatoria)、魚腥藍細菌屬(Anabaena) 、念珠藍細菌屬(Nostoc)、真枝藍細菌屬(Stigonema)等
14組 綠菌 綠菌屬(Chlorobium)、暗網菌屬(Pelodictyon)
二、變形桿菌
細菌
變形桿菌界 (Proteobacteria)
15組 α?變形桿菌 紅螺菌屬(Rhodospirillum)、立克次氏體屬(Rickettsia)、柄桿菌屬(Caulobacter)、根瘤菌屬(Rhizobium)、布魯氏菌屬(Brucella)、硝化桿菌屬(Nitrobacter)、甲基桿菌屬(Methylobacteriun)等
16組 β?變形桿菌 奈瑟氏菌屬(Neisseria)、產堿桿菌 屬(Alcaligenes)、亞硝化單胞菌屬(Nitrosomonas)、嗜甲基菌屬(Methylophilus)、硫桿菌 屬(Thiobacillus)、伯克霍爾德氏菌屬(Burkholderia)等
17組 γ?變形桿菌 著色菌屬(Chromatium)、亮發(fā)菌屬( Leucothrix)、軍團菌屬(Legionella)、假單胞菌屬(Pseudomonas)、固氮菌屬(Azotobacter )、弧菌屬(Vibrio)、埃希氏菌屬(Escherichia)、克雷伯氏菌屬(Klebsiella)、變形桿菌屬 (Proteus)、沙門氏菌屬(Salmonella)、志賀氏菌屬(Shigella)、伊爾森氏菌屬(Yersinia) 、嗜血桿菌屬(Haemophilus)
18組 δ?變形桿菌 脫硫弧菌屬(Desulfovibrio)、蛭 弧菌屬(Bodellovibiro)、粘球菌屬(Myxococcus)、多囊菌屬(Polyangium)
19組 ε?變形桿菌 彎曲桿菌屬(Campylobacter)、螺桿菌屬(Helicobacter)
三、低G+C含量的革蘭氏陽性細菌
20組 梭菌和有關的細菌 梭菌屬(Clostridium)、消化鏈 球菌屬(Peptostreptococcus)、真桿菌屬(Eubacterium)、脫硫腸狀菌屬(Desulfotomaculum )、韋榮氏菌屬(Veillonella)等
21組 柔膜菌 枝原體屬(Mycoplasma)、尿原體屬(Ureaplasma)、螺原體屬(Spiroplasma)、無膽甾原體屬(Acholeplasma)
22組 芽孢桿菌和乳桿菌 芽孢桿菌屬(Bacillus)、顯核菌屬(Caryophanon)、類芽孢桿菌屬(Paenibacillus)、高溫放線菌屬(Thermoactinomyces)、乳桿菌屬( Lactobacillus)、鏈球菌屬(Streptococcus)、腸球菌屬(Enterococcus)、葡萄球菌屬(Staphylococcus)、利斯特氏菌屬(Listeria)
四、高G+C含量的革蘭氏陽性細菌
23組 放線桿菌綱(Actinobacteria) 放線菌屬(Actinomyces)、微球菌屬(Micrococcus)、節(jié)桿菌屬(Arthrobacter)、棒桿菌屬(C orynebacterium)、分枝桿菌屬(Mycobacterium)、諾卡氏菌屬(Nocardia)、游動放線菌屬(A ctinoplanes)、丙酸桿菌屬(Propionibacterium)鏈霉菌屬(Streptomyces)、高溫單孢菌屬( Thermomonospora)、弗蘭克氏菌屬(Frankia)、馬杜拉放線菌屬(Actinomadure)、雙歧桿菌 屬(Bifidobacterium)
五、浮霉狀菌、螺旋體、絲桿菌、擬桿菌和梭桿菌
24組 浮霉狀菌、衣原體和有關的細菌 浮霉狀菌屬(Planctomyces)、衣原體屬(Chlamydia)
25組 螺旋體 螺旋體屬(Spirochaeta)、疏螺旋體屬(Borrelia)、 密螺旋體屬(Treponema)、小蛇菌屬(Serpulina)、鉤端螺旋體屬(Leptospira)
26組 絲狀桿菌 絲狀桿菌屬(Fibrobacter)
27組 擬桿菌 擬桿菌屬(Bacteriodes)、卟啉單胞菌屬(Porphyromonas)、普雷沃氏菌屬(Prevotella)
28組 黃桿菌 黃桿菌屬(Flavobacterium)
29組 鞘氨醇桿菌、屈撓桿菌和噬纖維菌 鞘氨醇桿菌屬(Sphingobacterium)、屈撓桿菌屬(Flexibacter)、噬纖維菌屬(Cytophaga)
30組 梭桿菌 梭桿菌屬(Fusobacterium)
第二版更多地采用核酸序列資料對分類群進行新的調整,無疑這是細菌系統(tǒng)發(fā)育分類的重大進展,但另一方面,我們也應看到:在某些類群中,由于序列特征與某些重要的表型特征相矛盾,這將給主要按表型特征進行細菌鑒定帶來新的困難,如何解決這些問題 ,有待進一步研究。

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