生物醫(yī)學(xué)論文潤色
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生物醫(yī)學(xué)論文潤色
狂犬病與埃博拉病毒病的傳播動態(tài)及其病原的系統(tǒng)發(fā)育地理學(xué)研究
第一章 前 言
目前傳染病的復(fù)發(fā)和流行已不僅是健康問題,也成為涉及到社會穩(wěn)定和人心安定的全球公共衛(wèi)生問題,這也提示了開展傳染病流行和傳播規(guī)律、傳播風(fēng)險評估及預(yù)測預(yù)警研究的必要性。
傳染病的發(fā)生與流行,是病原體、環(huán)境和宿主三者相互作用的結(jié)果,其影響因素多而且具有明顯的區(qū)域性差異,自然條件、社會經(jīng)濟(jì)狀況以及人類生產(chǎn)活動、
行為方式等環(huán)境因素不僅直接影響傳染病的傳播,而且還決定病原體及其宿主、媒介的時空分布,從而導(dǎo)致傳染病和病原的分布往往具有明顯的時空特異性。
因此,目前迫切需要采用新的技術(shù)手段,開展傳染病分布動態(tài)及傳播風(fēng)險預(yù)測,環(huán)境因素對傳染病傳播、蔓延和疫區(qū)演化、變遷的影響,
傳染病病原體的時空遷移圖譜以及病原體、環(huán)境和宿主之間相互作用的研究。
近些年,人們逐漸認(rèn)識到時間、空間這兩個關(guān)鍵的信息能給傳染病及其病原的研究帶來巨大價值,從而促進(jìn)了空間信息技術(shù)和系統(tǒng)發(fā)育地理學(xué)分析技術(shù)在公共衛(wèi)生領(lǐng)域的快速發(fā)展與應(yīng)用。
它們從傳染病本身及其病原體的角度出發(fā),有效地利用了現(xiàn)有的數(shù)據(jù),主要目的在于全面系統(tǒng)地挖掘傳染病流行病學(xué)特征、傳播動態(tài)及其時空分布格局,
從而探索和評估與傳染病相關(guān)的因素,以期更好地認(rèn)識傳染病的流行規(guī)律和傳播風(fēng)險,從而為制訂防控策略、進(jìn)行快速有效的應(yīng)急反應(yīng)提供科學(xué)支持,保障人類健康和生命安全。
第二章 我國狂犬病的傳播動態(tài)及其病原的系統(tǒng)發(fā)育地理學(xué)研究
2.1 研究背景
我國目前是全球狂犬病流行的重災(zāi)區(qū),尤其是我國的農(nóng)村地區(qū),我國的狂犬病發(fā)病率在全球排名第二,僅次于印度[7],所以說狂犬病是我國一個長存已久的嚴(yán)重的公共衛(wèi)生問題。
狂犬病在我國屬于乙類傳染病,其死亡人數(shù)一直居我國法定報(bào)告?zhèn)魅静∷劳鰯?shù)的前三位,對我國人民的健康構(gòu)成了嚴(yán)重威脅,是嚴(yán)重的公共衛(wèi)生問題。
1950-2004 年期間,我國就報(bào)道了將近 108412 例狂犬病病例[8,9]。
近些年,由于我國經(jīng)濟(jì)的快速增長,人們跨區(qū)遷徙、飼養(yǎng)寵物等活動日益頻繁,使得我國狂犬病在 20 世紀(jì)末期就迎來了狂犬病第三波流行高峰,
同時也呈現(xiàn)出疫區(qū)擴(kuò)散的趨勢,我國近十年來每年因狂犬病死亡人數(shù)平均都超過了 1000 例[10,11]。
有報(bào)道指出狂犬病復(fù)發(fā)和擴(kuò)散的主要原因是近些年我國本地犬?dāng)?shù)量的快速增長、較低的犬免疫覆蓋率和人被犬抓傷或咬傷暴露后的消極治療[12-16]。
此外,我國部分農(nóng)村地區(qū)可能存在漏報(bào)的情況,加上本地犬?dāng)?shù)目和動物狂犬病綜合監(jiān)測等數(shù)據(jù)的缺乏,導(dǎo)致國內(nèi)目前對狂犬病的疾病負(fù)擔(dān)估計(jì)也相對局限[15,17]。
2.2 資料來源及處理
為了描述我國狂犬病的發(fā)病趨勢和季節(jié)性特征,利用 Microsoft Excel 2010 整理2004-2013 年我國狂犬病患者的報(bào)告卡數(shù)據(jù),統(tǒng)計(jì)全國逐月發(fā)病率和年發(fā)病率,
繪制并疊加月發(fā)病率柱狀圖和年發(fā)病率流行曲線;為了描述我國狂犬病的發(fā)病人群特征,以 10 歲為間隔劃分年齡組(50 歲以上單獨(dú)為一組),統(tǒng)計(jì)各年齡組的男女發(fā)病率,
并用柱狀圖表示,并統(tǒng)計(jì)不同職業(yè)人群的發(fā)病百分比,同時統(tǒng)計(jì)不同時間段、不同縣區(qū)的人群分布特征,比較它們的差異;為了探索我國狂犬病的時空分布動態(tài),
根據(jù)我國各縣區(qū)狂犬病的發(fā)病數(shù)和人口數(shù)計(jì)算各縣區(qū)的年發(fā)病率,利用 ArcGIS 軟件,通過縣區(qū)代碼將各縣區(qū)的流行情況與全國縣區(qū)基礎(chǔ)地圖關(guān)聯(lián),
繪制每年的縣區(qū)發(fā)病率分布圖,展示發(fā)病率逐年的動態(tài)分布趨勢;為了更好地展示和比較各省流行的動態(tài)變化,統(tǒng)計(jì)各省的狂犬病年發(fā)病數(shù),以柱狀圖的形式展示各省近十年的發(fā)病變化。
第三章 塞拉利昂埃博拉病毒病的傳播動態(tài)及干預(yù)措施效能研究........................44
3.1 研究背景..... 44
3.2 資料來源.......... 46
3.3 分析方法..................49
第四章 塞拉利昂埃博拉病毒的遺傳多樣性及其系統(tǒng)發(fā)育地理學(xué)研究................88
4.1 研究背景...............88
4.2 資料來源.....................89
4.3 分析方法...........................90
4.4 研究結(jié)果.........................91
第五章 全文總結(jié)...................107
第四章 塞拉利昂埃博拉病毒的遺傳多樣性及其系統(tǒng)發(fā)育地理學(xué)研究
4.1 研究背景
2014 年前,研究人員從非人類靈長類動物中獲取的 EBOV 全基因組序列較少,根據(jù)僅有的一些序列進(jìn)行了分子鐘溯源進(jìn)化分析,發(fā)現(xiàn)這五種亞型在數(shù)千年前就開始分化。
有研究者對 2013 年前的 97 株絲狀病毒的基因組進(jìn)行了共同祖先分析,發(fā)現(xiàn)萊斯頓型 EBOV 和扎伊爾型 EBOV 的共同祖先可能出現(xiàn)在 50 年前,馬爾堡病毒和蘇丹型的共同祖先則出現(xiàn)在 700 年~850 年前[5,7]。
近些年,基于基因測序的實(shí)時PCR 技術(shù)快速發(fā)展,實(shí)際應(yīng)用中不但能夠?qū)崟r獲得檢測結(jié)果,還可以通過設(shè)計(jì)不同的引物對病原耐藥位點(diǎn)、毒力位點(diǎn)突變情況進(jìn)行檢測,從而指導(dǎo)臨床救治和疫情防控。
隨著新一代測序技術(shù)的發(fā)展,2014 年西非疫情暴發(fā)后,中國、美國、英國、法國、荷蘭等國的傳染病防控專家不僅積極協(xié)助西非防控 EVD 疫情,
而且也為 EBOV的科學(xué)研究做出了重要的貢獻(xiàn),共測出了近千條 EBOV 的全基因組序列,為 EBOV的分子進(jìn)化特征研究、疫苗和治療藥物的研制等方面做了很好鋪墊。
4.2 資料來源
收集所有公開發(fā)表的、來自塞拉利昂的 EBOV 全基因組序列,該序列中記錄樣本的采樣時間和采樣地點(diǎn),該數(shù)據(jù)主要來源于美國共享的 GenBank 數(shù)據(jù)庫
下載的序列有部分缺乏發(fā)病地點(diǎn)和分離時間等信息,這些缺失的信息主要從已發(fā)表的文獻(xiàn)中補(bǔ)充獲取[8-11,17]。
另外,我們還收集了 3 條來自幾內(nèi)亞國家的 EBOV 全基因組序列,這 3 條序列是西非 EVD 疫情中最早分離出來的序列,納入這 3 條序列旨在于確定系統(tǒng)發(fā)育樹的根。
此外,中國移動實(shí)驗(yàn)檢測隊(duì)在塞拉利昂執(zhí)行 EBOV 檢測任務(wù)期間,測序了60 條新的 EBOV 全基因序列,采樣時間為 2014 年 10 月 7 日至 2014 年 11 月 11日。
本研究納入了這 60 條新的 EBOV 全基因組序列。
第五章 全文總結(jié)
我國狂犬病的傳播動態(tài)及其病原的系統(tǒng)發(fā)育地理學(xué)研究:明確了我國近十年來狂犬病疫情的流行動態(tài)及三間分布特征,探索了高發(fā)熱點(diǎn)區(qū)的演化趨勢,
通過將狂犬病的時空擴(kuò)散動態(tài)進(jìn)行可視化展示,我們?nèi)娴卣J(rèn)識到我國狂犬病在近些年的發(fā)病總數(shù)雖逐年下降,但總體疫情卻呈現(xiàn)出一種―由高發(fā)區(qū)向低發(fā)區(qū)或無病例區(qū)擴(kuò)散,
由東部、南部地區(qū)向西部、北部地區(qū)擴(kuò)散‖的流行態(tài)勢,這表明我國狂犬病的防控工作不僅要關(guān)注高發(fā)地區(qū),還應(yīng)加強(qiáng)對高發(fā)區(qū)周邊的低發(fā)地區(qū)和新出現(xiàn)疫情地區(qū)的防控工作。
另外,利用面板 Poisson 回歸,我們探索并評估了人均經(jīng)濟(jì)水平和人均教育水平對我國狂犬病流行的影響,還發(fā)現(xiàn)了動物疫情的暴發(fā)對狂犬病的流行具有預(yù)警作用,
這些提示著我國應(yīng)重點(diǎn)關(guān)注農(nóng)村地區(qū)或落后地區(qū)的狂犬病防控工作,提高這些地區(qū)的衛(wèi)生資源分配和防控力度。
通過進(jìn)一步的系統(tǒng)發(fā)育地理學(xué)研究,發(fā)現(xiàn)我國狂犬病高發(fā)地區(qū)的狂犬病毒遺傳多樣性比較豐富,低發(fā)地區(qū)則比較單一,這很好地提示了這些高發(fā)地區(qū)可能是狂犬病毒進(jìn)化和對外傳播的中心區(qū)。
我們同時還明確了Clade I 和 Clade II 這兩大狂犬病毒家系是我國近些年狂犬病流行和擴(kuò)散的主要家系,尤其是 Clade I-G,這給我國未來的狂犬病病原監(jiān)測和疫苗研究提供了重點(diǎn)方向。
參考文獻(xiàn)(略)
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基于關(guān)節(jié)數(shù)據(jù)和極限學(xué)習(xí)機(jī)的人體動作識別
1緒論
隨著計(jì)算機(jī)圖形學(xué)的快速發(fā)展,以及對物理學(xué)應(yīng)用的進(jìn)一步完善,人們制作出越來越多的和人體動作相關(guān)的視頻數(shù)據(jù),對視頻分類技術(shù)的需求也不斷增長。
近年來,人體動作的識別在多個領(lǐng)域表現(xiàn)出廣闊的應(yīng)用前景和研宄價值,其中基于關(guān)節(jié)數(shù)據(jù)的人體動作識別更是成為計(jì)算機(jī)視覺領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。
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